Of het systeem nu natuurlijk of mechanisch is, hygiënische ventilatie kan aanzienlijke geluidsoverlast veroorzaken, zowel in de woning als voor de omwonenden. In de praktijk worden te luidruchtige systemen uiteindelijk door de gebruikers uitgeschakeld, wat ten koste gaat van de luchtkwaliteit. Voor elke situatie bestaan er echter oplossingen.

Het is dan ook essentieel om het akoestische aspect vanaf het ontwerp van het systeem te bestuderen en mee te nemen.